Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFE2Q16621 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NFE2Q16621 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFE2Q16621 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NFE2Q16621 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2Q16621 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2Q16621 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2Q16621 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2Q16621 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2Q16621 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2Q16621 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2Q16621 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2Q16621 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2Q16621 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFE2Q16621 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFE2Q16621 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFE2Q16621 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFE2Q16621 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFE2Q16621 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFE2Q16621 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NFE2Q16621 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NFE2Q16621 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NFE2Q16621 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NFE2Q16621 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NFE2Q16621 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFE2Q16621 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NFE2Q16621 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFE2Q16621 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NFE2Q16621 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms