Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FXNQ16595 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FXNQ16595 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FXNQ16595 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FXNQ16595 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FXNQ16595 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FXNQ16595 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FXNQ16595 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FXNQ16595 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FXNQ16595 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FXNQ16595 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FXNQ16595 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FXNQ16595 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FXNQ16595 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FXNQ16595 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FXNQ16595 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FXNQ16595 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FXNQ16595 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FXNQ16595 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FXNQ16595 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FXNQ16595 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FXNQ16595 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FXNQ16595 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FXNQ16595 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FXNQ16595 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FXNQ16595 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FXNQ16595 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FXNQ16595 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FXNQ16595 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FXNQ16595 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FXNQ16595 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FXNQ16595 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FXNQ16595 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FXNQ16595 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FXNQ16595 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FXNQ16595 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FXNQ16595 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FXNQ16595 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FXNQ16595 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FXNQ16595 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FXNQ16595 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FXNQ16595 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FXNQ16595 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FXNQ16595 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FXNQ16595 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FXNQ16595 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FXNQ16595 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FXNQ16595 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FXNQ16595 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FXNQ16595 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FXNQ16595 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FXNQ16595 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FXNQ16595 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FXNQ16595 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FXNQ16595 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FXNQ16595 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FXNQ16595 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FXNQ16595 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FXNQ16595 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FXNQ16595 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FXNQ16595 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FXNQ16595 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FXNQ16595 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FXNQ16595 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FXNQ16595 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FXNQ16595 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FXNQ16595 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FXNQ16595 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FXNQ16595 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FXNQ16595 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FXNQ16595 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FXNQ16595 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FXNQ16595 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FXNQ16595 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FXNQ16595 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FXNQ16595 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FXNQ16595 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FXNQ16595 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FXNQ16595 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FXNQ16595 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FXNQ16595 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FXNQ16595 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FXNQ16595 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FXNQ16595 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FXNQ16595 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FXNQ16595 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FXNQ16595 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FXNQ16595 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FXNQ16595 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FXNQ16595 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FXNQ16595 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FXNQ16595 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FXNQ16595 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FXNQ16595 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FXNQ16595 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FXNQ16595 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FXNQ16595 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FXNQ16595 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FXNQ16595 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FXNQ16595 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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