Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GABRA6Q16445 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRA6Q16445 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GABRA6Q16445 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABRA6Q16445 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABRA6Q16445 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GABRA6Q16445 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GABRA6Q16445 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
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