Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USF2Q15853 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USF2Q15853 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USF2Q15853 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USF2Q15853 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USF2Q15853 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USF2Q15853 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USF2Q15853 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USF2Q15853 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USF2Q15853 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USF2Q15853 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USF2Q15853 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USF2Q15853 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USF2Q15853 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USF2Q15853 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USF2Q15853 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USF2Q15853 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USF2Q15853 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USF2Q15853 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USF2Q15853 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USF2Q15853 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USF2Q15853 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USF2Q15853 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USF2Q15853 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USF2Q15853 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USF2Q15853 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USF2Q15853 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USF2Q15853 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USF2Q15853 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USF2Q15853 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USF2Q15853 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USF2Q15853 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USF2Q15853 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USF2Q15853 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USF2Q15853 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USF2Q15853 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USF2Q15853 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USF2Q15853 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USF2Q15853 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USF2Q15853 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USF2Q15853 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USF2Q15853 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USF2Q15853 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USF2Q15853 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USF2Q15853 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
USF2Q15853 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USF2Q15853 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
USF2Q15853 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USF2Q15853 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
USF2Q15853 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USF2Q15853 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USF2Q15853 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USF2Q15853 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USF2Q15853 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USF2Q15853 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USF2Q15853 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USF2Q15853 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
USF2Q15853 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
USF2Q15853 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USF2Q15853 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USF2Q15853 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USF2Q15853 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USF2Q15853 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
USF2Q15853 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
USF2Q15853 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USF2Q15853 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
USF2Q15853 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USF2Q15853 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USF2Q15853 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USF2Q15853 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USF2Q15853 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USF2Q15853 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USF2Q15853 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USF2Q15853 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USF2Q15853 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USF2Q15853 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USF2Q15853 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USF2Q15853 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USF2Q15853 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
USF2Q15853 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USF2Q15853 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USF2Q15853 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USF2Q15853 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USF2Q15853 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
USF2Q15853 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
USF2Q15853 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USF2Q15853 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USF2Q15853 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USF2Q15853 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USF2Q15853 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USF2Q15853 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
USF2Q15853 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
USF2Q15853 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
USF2Q15853 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USF2Q15853 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USF2Q15853 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USF2Q15853 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USF2Q15853 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USF2Q15853 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
USF2Q15853 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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