Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP3Q15836 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
VAMP3Q15836 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP3Q15836 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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