Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNA6Q15825 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNA6Q15825 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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