Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TRIP11Q15643 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIP11Q15643 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIP11Q15643 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
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