Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCN1Q15293 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCN1Q15293 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCN1Q15293 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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