Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDK3Q15120 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDK3Q15120 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDK3Q15120 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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