Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SHPRHQ149N8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SHPRHQ149N8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHPRHQ149N8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SHPRHQ149N8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
SHPRHQ149N8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
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