Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SMC1AQ14683 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMC1AQ14683 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 808.8 ms