Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF235Q14590 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF235Q14590 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF235Q14590 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
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