Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
KCNC3Q14003 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNC3Q14003 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNC3Q14003 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNC3Q14003 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms