Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2H3Q13889 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2H3Q13889 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2H3Q13889 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2H3Q13889 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
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