Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX1Q13596 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX1Q13596 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX1Q13596 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX1Q13596 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
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