Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 TPM3-212ENST00000368533 3131 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.884e-13■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 DNAJA2-202ENST00000563158 1825 ntTSL 59.56□□□□□ -0.887e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 DNAJA2-204ENST00000617000 1885 ntTSL 29.52□□□□□ -0.897e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 FBXW7-212ENST00000604872 970 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.897e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 TPM3-209ENST00000368527 569 ntTSL 49.19□□□□□ -0.944e-13■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 SCAF8-202ENST00000367186 4908 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.957e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 SUZ12P1-206ENST00000582557 1560 ntTSL 1 (best)9.05□□□□□ -0.967e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 TPM3-201ENST00000271850 1219 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.994e-13■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 TPM3-218ENST00000505010 540 ntTSL 28.79□□□□□ -12e-12■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 RPS24-207ENST00000466129 661 ntTSL 28.74□□□□□ -1.016e-29■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 PSME2-209ENST00000559453 1721 ntTSL 58.74□□□□□ -1.017e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 AL390728.4-201ENST00000421406 1465 ntBASIC8.71□□□□□ -1.017e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 FBXW7-207ENST00000603841 2261 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.027e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 SLU7-201ENST00000297151 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.059e-7■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 ZNF3-215ENST00000487620 2660 ntTSL 28.25□□□□□ -1.097e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 FBXW7-205ENST00000603548 2562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.17e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 TPM3-203ENST00000312970 750 ntTSL 58.09□□□□□ -1.114e-13■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 PSME2-207ENST00000559056 512 ntTSL 58.09□□□□□ -1.117e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 ZNF3-207ENST00000424697 2718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.177e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.177e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 ZNF3-202ENST00000299667 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.277e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 HDAC1-204ENST00000471488 726 ntTSL 56.9□□□□□ -1.37e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 TPM3-215ENST00000469717 4041 ntTSL 26.89□□□□□ -1.314e-13■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.427e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 PRPF4B-205ENST00000480058 6775 ntTSL 1 (best)5.52□□□□□ -1.531e-7■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 PSME2-210ENST00000559493 702 ntTSL 25.26□□□□□ -1.577e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.61e-7■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 FBXW7-213ENST00000605042 671 ntTSL 34.83□□□□□ -1.647e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 PPP1R12A-217ENST00000550903 959 ntTSL 54.33□□□□□ -1.722e-8■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 SUZ12P1-205ENST00000582329 785 ntTSL 54.12□□□□□ -1.757e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 CALD1-214ENST00000466704 903 ntTSL 33.28□□□□□ -1.887e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 EHBP1-213ENST00000462441 332 ntTSL 32.47□□□□□ -2.017e-6■■■■□ 25.8
TRA2AQ13595 PPP1R12A-219ENST00000551781 629 ntTSL 52.02□□□□□ -2.091e-8■■■■□ 25.8
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TRA2AQ13595 NXF1-217ENST00000533671 589 ntTSL 417.09■□□□□ 0.336e-8■■■■□ 25.7
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TRA2AQ13595 NXF1-207ENST00000530875 1922 ntTSL 1 (best)13.21□□□□□ -0.36e-8■■■■□ 25.7
TRA2AQ13595 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.46e-8■■■■□ 25.7
TRA2AQ13595 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.46e-8■■■■□ 25.7
TRA2AQ13595 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.446e-8■■■■□ 25.7
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TRA2AQ13595 NXF1-208ENST00000531131 1023 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.626e-8■■■■□ 25.7
TRA2AQ13595 PARP1-206ENST00000469663 542 ntTSL 310.71□□□□□ -0.696e-8■■■■□ 25.7
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TRA2AQ13595 SRRM1-222ENST00000596378 2314 ntTSL 1 (best)20.04■□□□□ 0.83e-8■■■■□ 25.7
TRA2AQ13595 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.022e-7■■■■□ 25.6
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TRA2AQ13595 HNRNPR-203ENST00000374616 2691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.672e-7■■■■□ 25.6
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TRA2AQ13595 HNRNPR-201ENST00000302271 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.82e-7■■■■□ 25.6
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TRA2AQ13595 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.124e-7■■■■□ 25.6
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TRA2AQ13595 BUB1B-203ENST00000557848 633 ntTSL 34.77□□□□□ -1.653e-10■■■■□ 25.5
TRA2AQ13595 NASP-208ENST00000470768 1036 ntTSL 313.59□□□□□ -0.233e-8■■■■□ 25.4
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TRA2AQ13595 SLTM-220ENST00000559880 717 ntTSL 310.3□□□□□ -0.761e-6■■■■□ 25.3
TRA2AQ13595 ZMAT2-201ENST00000274712 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.91e-6■■■■□ 25.3
TRA2AQ13595 SLTM-226ENST00000628684 1040 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.911e-6■■■■□ 25.3
TRA2AQ13595 ZMAT2-202ENST00000506644 735 ntTSL 38.01□□□□□ -1.131e-6■■■■□ 25.3
TRA2AQ13595 SLTM-213ENST00000557950 924 ntTSL 37.16□□□□□ -1.265e-7■■■■□ 25.3
TRA2AQ13595 SLTM-215ENST00000558486 585 ntTSL 45.73□□□□□ -1.495e-7■■■■□ 25.3
TRA2AQ13595 SLTM-219ENST00000559305 559 ntTSL 45.37□□□□□ -1.551e-6■■■■□ 25.3
TRA2AQ13595 SLTM-201ENST00000249736 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 55.26□□□□□ -1.571e-6■■■■□ 25.3
TRA2AQ13595 SLTM-224ENST00000560682 495 ntTSL 34.97□□□□□ -1.615e-7■■■■□ 25.3
TRA2AQ13595 SLTM-217ENST00000558756 896 ntTSL 54.24□□□□□ -1.731e-6■■■■□ 25.3
TRA2AQ13595 U2SURP-209ENST00000480029 2855 ntTSL 22.9□□□□□ -1.958e-7■■■■□ 25.1
TRA2AQ13595 CFDP1-205ENST00000565646 608 ntTSL 312.22□□□□□ -0.456e-8■■■■□ 25.1
TRA2AQ13595 CFDP1-201ENST00000283882 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.516e-8■■■■□ 25.1
TRA2AQ13595 CFDP1-207ENST00000566901 1167 ntTSL 1 (best)11.85□□□□□ -0.516e-8■■■■□ 25.1
TRA2AQ13595 CFDP1-203ENST00000564286 775 ntTSL 510.73□□□□□ -0.696e-8■■■■□ 25.1
TRA2AQ13595 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC6.72□□□□□ -1.334e-40■■■■□ 25.1
TRA2AQ13595 SNORD91A-201ENST00000390861 95 nt0.55□□□□□ -2.324e-40■■■■□ 25.1
TRA2AQ13595 DDX27-202ENST00000462328 824 ntTSL 516.87■□□□□ 0.291e-7■■■■□ 25.1
TRA2AQ13595 DDX27-204ENST00000484427 4929 ntTSL 1 (best)11.99□□□□□ -0.491e-7■■■■□ 25.1
TRA2AQ13595 DDX27-205ENST00000493252 825 ntTSL 311.72□□□□□ -0.531e-7■■■■□ 25.1
TRA2AQ13595 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.551e-7■■■■□ 25.1
TRA2AQ13595 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.631e-7■■■■□ 25.1
TRA2AQ13595 RBMX2-205ENST00000639890 871 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.641e-7■■■■□ 25.1
TRA2AQ13595 RTF1-202ENST00000462276 485 ntTSL 410.25□□□□□ -0.771e-7■■■■□ 25.1
TRA2AQ13595 DDX27-207ENST00000622530 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.841e-7■■■■□ 25.1
TRA2AQ13595 RBMX2-201ENST00000305536 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.911e-7■■■■□ 25.1
TRA2AQ13595 RTF1-205ENST00000558298 327 ntTSL 57.63□□□□□ -1.191e-7■■■■□ 25.1
TRA2AQ13595 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.061e-7■■■■□ 25
TRA2AQ13595 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.031e-7■■■■□ 25
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