Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSAMPQ13449 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSAMPQ13449 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LSAMPQ13449 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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