Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS2P3Q13401 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PMS2P3Q13401 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms