Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCGB2A2Q13296 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCGB2A2Q13296 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SCGB2A2Q13296 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SCGB2A2Q13296 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCGB2A2Q13296 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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SCGB2A2Q13296 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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SCGB2A2Q13296 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCGB2A2Q13296 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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