Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC41.95■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
PRDM2Q13029 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
PRDM2Q13029 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
PRDM2Q13029 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
PRDM2Q13029 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
PRDM2Q13029 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
PRDM2Q13029 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
PRDM2Q13029 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
PRDM2Q13029 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
PRDM2Q13029 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
PRDM2Q13029 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
PRDM2Q13029 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
PRDM2Q13029 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
PRDM2Q13029 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
PRDM2Q13029 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
PRDM2Q13029 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
PRDM2Q13029 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
PRDM2Q13029 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
PRDM2Q13029 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
PRDM2Q13029 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
PRDM2Q13029 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
PRDM2Q13029 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
PRDM2Q13029 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
PRDM2Q13029 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
PRDM2Q13029 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
PRDM2Q13029 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
PRDM2Q13029 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
PRDM2Q13029 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
PRDM2Q13029 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
PRDM2Q13029 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
PRDM2Q13029 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
PRDM2Q13029 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
PRDM2Q13029 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
PRDM2Q13029 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
PRDM2Q13029 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
PRDM2Q13029 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
PRDM2Q13029 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
PRDM2Q13029 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
PRDM2Q13029 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
PRDM2Q13029 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC41.75■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC41.74■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC41.72■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC41.71■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC41.7■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.27
PRDM2Q13029 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
PRDM2Q13029 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
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