Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TROQ12816 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
TROQ12816 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
TROQ12816 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
TROQ12816 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
TROQ12816 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
TROQ12816 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
TROQ12816 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TROQ12816 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TROQ12816 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TROQ12816 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TROQ12816 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TROQ12816 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TROQ12816 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TROQ12816 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
TROQ12816 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TROQ12816 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TROQ12816 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TROQ12816 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.54■■■■□ 3.6
TROQ12816 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TROQ12816 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TROQ12816 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TROQ12816 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TROQ12816 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TROQ12816 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TROQ12816 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TROQ12816 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TROQ12816 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TROQ12816 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
TROQ12816 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
TROQ12816 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
TROQ12816 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
TROQ12816 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
TROQ12816 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TROQ12816 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TROQ12816 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
TROQ12816 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TROQ12816 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TROQ12816 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TROQ12816 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TROQ12816 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TROQ12816 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TROQ12816 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TROQ12816 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TROQ12816 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TROQ12816 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
TROQ12816 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
TROQ12816 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TROQ12816 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TROQ12816 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
TROQ12816 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TROQ12816 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TROQ12816 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TROQ12816 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TROQ12816 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TROQ12816 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
TROQ12816 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TROQ12816 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TROQ12816 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TROQ12816 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TROQ12816 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TROQ12816 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TROQ12816 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TROQ12816 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TROQ12816 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TROQ12816 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TROQ12816 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TROQ12816 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TROQ12816 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
TROQ12816 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TROQ12816 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TROQ12816 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TROQ12816 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TROQ12816 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TROQ12816 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TROQ12816 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TROQ12816 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TROQ12816 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
TROQ12816 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TROQ12816 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TROQ12816 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TROQ12816 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TROQ12816 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TROQ12816 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TROQ12816 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TROQ12816 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TROQ12816 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TROQ12816 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TROQ12816 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TROQ12816 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TROQ12816 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TROQ12816 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TROQ12816 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TROQ12816 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TROQ12816 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TROQ12816 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TROQ12816 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TROQ12816 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TROQ12816 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TROQ12816 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
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