Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C2orf54Q08AI8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2orf54Q08AI8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms