Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TNK2Q07912 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNK2Q07912 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNK2Q07912 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms