Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TLE4Q04727 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TLE4Q04727 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TLE4Q04727 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms