Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFF2Q03403 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TFF2Q03403 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFF2Q03403 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms