Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF9Q00978 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IRF9Q00978 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IRF9Q00978 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms