Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPCAP84074 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPCAP84074 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPCAP84074 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HPCAP84074 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPCAP84074 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPCAP84074 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPCAP84074 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPCAP84074 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPCAP84074 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPCAP84074 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPCAP84074 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPCAP84074 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HPCAP84074 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPCAP84074 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPCAP84074 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HPCAP84074 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HPCAP84074 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPCAP84074 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HPCAP84074 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPCAP84074 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HPCAP84074 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HPCAP84074 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPCAP84074 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPCAP84074 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPCAP84074 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPCAP84074 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPCAP84074 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPCAP84074 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPCAP84074 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPCAP84074 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HPCAP84074 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HPCAP84074 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HPCAP84074 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPCAP84074 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPCAP84074 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPCAP84074 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPCAP84074 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPCAP84074 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPCAP84074 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HPCAP84074 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HPCAP84074 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPCAP84074 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPCAP84074 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HPCAP84074 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPCAP84074 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPCAP84074 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPCAP84074 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPCAP84074 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPCAP84074 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPCAP84074 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPCAP84074 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPCAP84074 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPCAP84074 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPCAP84074 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPCAP84074 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPCAP84074 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPCAP84074 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPCAP84074 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPCAP84074 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPCAP84074 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPCAP84074 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPCAP84074 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HPCAP84074 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPCAP84074 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPCAP84074 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPCAP84074 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPCAP84074 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPCAP84074 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPCAP84074 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPCAP84074 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPCAP84074 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPCAP84074 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HPCAP84074 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPCAP84074 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPCAP84074 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPCAP84074 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPCAP84074 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPCAP84074 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPCAP84074 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HPCAP84074 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPCAP84074 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPCAP84074 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPCAP84074 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPCAP84074 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPCAP84074 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPCAP84074 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPCAP84074 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPCAP84074 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPCAP84074 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HPCAP84074 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPCAP84074 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPCAP84074 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPCAP84074 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPCAP84074 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPCAP84074 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPCAP84074 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPCAP84074 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HPCAP84074 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HPCAP84074 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms