Protein–RNA interactions for Protein: P78549

NTHL1, Endonuclease III-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTHL1P78549 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NTHL1P78549 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NTHL1P78549 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NTHL1P78549 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NTHL1P78549 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms