Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PITX1P78337 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PITX1P78337 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PITX1P78337 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PITX1P78337 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PITX1P78337 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PITX1P78337 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PITX1P78337 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PITX1P78337 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PITX1P78337 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PITX1P78337 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PITX1P78337 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITX1P78337 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITX1P78337 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITX1P78337 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITX1P78337 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITX1P78337 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITX1P78337 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PITX1P78337 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITX1P78337 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITX1P78337 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITX1P78337 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PITX1P78337 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITX1P78337 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PITX1P78337 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PITX1P78337 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PITX1P78337 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PITX1P78337 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PITX1P78337 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PITX1P78337 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PITX1P78337 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PITX1P78337 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PITX1P78337 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PITX1P78337 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PITX1P78337 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PITX1P78337 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PITX1P78337 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PITX1P78337 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PITX1P78337 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PITX1P78337 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PITX1P78337 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PITX1P78337 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PITX1P78337 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PITX1P78337 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PITX1P78337 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PITX1P78337 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PITX1P78337 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PITX1P78337 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PITX1P78337 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITX1P78337 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITX1P78337 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITX1P78337 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITX1P78337 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITX1P78337 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PITX1P78337 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITX1P78337 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITX1P78337 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITX1P78337 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITX1P78337 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PITX1P78337 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PITX1P78337 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PITX1P78337 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PITX1P78337 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PITX1P78337 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PITX1P78337 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PITX1P78337 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PITX1P78337 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PITX1P78337 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PITX1P78337 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PITX1P78337 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PITX1P78337 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PITX1P78337 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PITX1P78337 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PITX1P78337 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PITX1P78337 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PITX1P78337 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PITX1P78337 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PITX1P78337 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PITX1P78337 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PITX1P78337 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PITX1P78337 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITX1P78337 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITX1P78337 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITX1P78337 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITX1P78337 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITX1P78337 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITX1P78337 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITX1P78337 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PITX1P78337 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PITX1P78337 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PITX1P78337 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PITX1P78337 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PITX1P78337 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PITX1P78337 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PITX1P78337 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PITX1P78337 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PITX1P78337 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PITX1P78337 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PITX1P78337 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PITX1P78337 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms