Protein–RNA interactions for Protein: P61006

RAB8A, Ras-related protein Rab-8A, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8AP61006 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB8AP61006 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB8AP61006 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB8AP61006 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms