Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMA6P60900 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA6P60900 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PSMA6P60900 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms