Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXW4P57775 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXW4P57775 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXW4P57775 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms