Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPTEP56180 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TPTEP56180 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPTEP56180 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPTEP56180 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPTEP56180 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPTEP56180 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPTEP56180 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPTEP56180 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPTEP56180 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPTEP56180 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPTEP56180 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPTEP56180 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPTEP56180 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPTEP56180 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPTEP56180 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPTEP56180 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPTEP56180 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPTEP56180 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPTEP56180 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPTEP56180 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPTEP56180 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPTEP56180 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPTEP56180 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPTEP56180 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPTEP56180 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPTEP56180 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPTEP56180 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPTEP56180 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPTEP56180 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPTEP56180 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPTEP56180 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPTEP56180 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPTEP56180 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPTEP56180 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TPTEP56180 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPTEP56180 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPTEP56180 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPTEP56180 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPTEP56180 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPTEP56180 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPTEP56180 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TPTEP56180 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TPTEP56180 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPTEP56180 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPTEP56180 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPTEP56180 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPTEP56180 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPTEP56180 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPTEP56180 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TPTEP56180 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPTEP56180 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPTEP56180 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPTEP56180 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPTEP56180 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPTEP56180 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPTEP56180 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTEP56180 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTEP56180 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTEP56180 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTEP56180 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTEP56180 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTEP56180 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTEP56180 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTEP56180 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTEP56180 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTEP56180 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTEP56180 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTEP56180 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTEP56180 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPTEP56180 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTEP56180 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTEP56180 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTEP56180 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTEP56180 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTEP56180 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTEP56180 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPTEP56180 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTEP56180 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTEP56180 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTEP56180 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTEP56180 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPTEP56180 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTEP56180 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTEP56180 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTEP56180 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTEP56180 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTEP56180 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPTEP56180 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPTEP56180 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPTEP56180 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTEP56180 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTEP56180 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTEP56180 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTEP56180 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTEP56180 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTEP56180 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTEP56180 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTEP56180 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPTEP56180 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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