Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EIF3BP55884 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EIF3BP55884 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EIF3BP55884 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms