Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CACNA2D1P54289 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA2D1P54289 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNA2D1P54289 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms