Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLNS1AP54105 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLNS1AP54105 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLNS1AP54105 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms