Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AP3M2P53677 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
AP3M2P53677 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP3M2P53677 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP3M2P53677 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms