Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPAP53621 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPAP53621 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COPAP53621 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COPAP53621 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPAP53621 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPAP53621 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPAP53621 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPAP53621 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPAP53621 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPAP53621 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COPAP53621 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COPAP53621 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPAP53621 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPAP53621 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPAP53621 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPAP53621 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPAP53621 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPAP53621 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPAP53621 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COPAP53621 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPAP53621 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COPAP53621 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPAP53621 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPAP53621 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPAP53621 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPAP53621 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPAP53621 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COPAP53621 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPAP53621 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPAP53621 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPAP53621 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COPAP53621 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPAP53621 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPAP53621 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPAP53621 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COPAP53621 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPAP53621 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPAP53621 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPAP53621 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPAP53621 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPAP53621 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPAP53621 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COPAP53621 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COPAP53621 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COPAP53621 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPAP53621 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPAP53621 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPAP53621 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPAP53621 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPAP53621 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPAP53621 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPAP53621 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPAP53621 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPAP53621 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPAP53621 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPAP53621 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPAP53621 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPAP53621 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPAP53621 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPAP53621 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPAP53621 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPAP53621 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPAP53621 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPAP53621 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPAP53621 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPAP53621 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPAP53621 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPAP53621 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPAP53621 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPAP53621 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPAP53621 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPAP53621 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPAP53621 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPAP53621 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPAP53621 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPAP53621 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPAP53621 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPAP53621 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPAP53621 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPAP53621 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPAP53621 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPAP53621 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPAP53621 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPAP53621 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPAP53621 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPAP53621 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPAP53621 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPAP53621 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPAP53621 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPAP53621 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COPAP53621 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPAP53621 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COPAP53621 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COPAP53621 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPAP53621 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPAP53621 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPAP53621 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPAP53621 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPAP53621 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms