Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUBP1P53384 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUBP1P53384 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUBP1P53384 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms