Protein–RNA interactions for Protein: P53041

PPP5C, Serine/threonine-protein phosphatase 5, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP5CP53041 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPP5CP53041 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPP5CP53041 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP5CP53041 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms