Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK3P51956 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK3P51956 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK3P51956 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEK3P51956 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEK3P51956 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEK3P51956 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEK3P51956 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK3P51956 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK3P51956 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK3P51956 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK3P51956 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEK3P51956 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK3P51956 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK3P51956 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEK3P51956 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK3P51956 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK3P51956 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK3P51956 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK3P51956 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEK3P51956 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK3P51956 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK3P51956 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK3P51956 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK3P51956 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK3P51956 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK3P51956 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK3P51956 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK3P51956 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK3P51956 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK3P51956 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK3P51956 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK3P51956 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK3P51956 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK3P51956 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK3P51956 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK3P51956 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK3P51956 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK3P51956 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK3P51956 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK3P51956 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK3P51956 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK3P51956 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK3P51956 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK3P51956 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK3P51956 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEK3P51956 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK3P51956 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK3P51956 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK3P51956 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK3P51956 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK3P51956 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK3P51956 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK3P51956 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK3P51956 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK3P51956 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK3P51956 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK3P51956 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK3P51956 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK3P51956 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK3P51956 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK3P51956 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK3P51956 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK3P51956 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK3P51956 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK3P51956 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK3P51956 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK3P51956 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK3P51956 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK3P51956 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK3P51956 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK3P51956 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK3P51956 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK3P51956 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK3P51956 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK3P51956 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK3P51956 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK3P51956 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK3P51956 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK3P51956 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK3P51956 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK3P51956 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK3P51956 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK3P51956 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEK3P51956 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEK3P51956 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK3P51956 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK3P51956 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK3P51956 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK3P51956 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK3P51956 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK3P51956 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK3P51956 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK3P51956 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK3P51956 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK3P51956 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK3P51956 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK3P51956 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK3P51956 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK3P51956 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms