Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSK3BP49841 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSK3BP49841 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms