Protein–RNA interactions for Protein: P49682

CXCR3, C-X-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR3P49682 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CXCR3P49682 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCR3P49682 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR3P49682 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms