Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NRIP1P48552 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NRIP1P48552 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NRIP1P48552 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NRIP1P48552 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms