Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ETV4P43268 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ETV4P43268 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ETV4P43268 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ETV4P43268 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ETV4P43268 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ETV4P43268 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ETV4P43268 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ETV4P43268 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ETV4P43268 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ETV4P43268 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETV4P43268 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETV4P43268 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETV4P43268 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETV4P43268 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ETV4P43268 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETV4P43268 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETV4P43268 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETV4P43268 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ETV4P43268 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ETV4P43268 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ETV4P43268 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETV4P43268 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETV4P43268 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETV4P43268 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETV4P43268 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETV4P43268 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETV4P43268 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETV4P43268 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETV4P43268 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ETV4P43268 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETV4P43268 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETV4P43268 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETV4P43268 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ETV4P43268 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ETV4P43268 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ETV4P43268 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ETV4P43268 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ETV4P43268 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ETV4P43268 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ETV4P43268 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ETV4P43268 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ETV4P43268 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ETV4P43268 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ETV4P43268 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ETV4P43268 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ETV4P43268 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ETV4P43268 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ETV4P43268 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ETV4P43268 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ETV4P43268 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ETV4P43268 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ETV4P43268 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ETV4P43268 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ETV4P43268 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ETV4P43268 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ETV4P43268 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ETV4P43268 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ETV4P43268 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ETV4P43268 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ETV4P43268 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ETV4P43268 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV4P43268 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV4P43268 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV4P43268 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV4P43268 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV4P43268 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV4P43268 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV4P43268 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV4P43268 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV4P43268 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV4P43268 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV4P43268 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV4P43268 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV4P43268 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV4P43268 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV4P43268 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV4P43268 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV4P43268 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ETV4P43268 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ETV4P43268 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ETV4P43268 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ETV4P43268 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ETV4P43268 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ETV4P43268 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ETV4P43268 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ETV4P43268 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ETV4P43268 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ETV4P43268 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ETV4P43268 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ETV4P43268 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ETV4P43268 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ETV4P43268 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ETV4P43268 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ETV4P43268 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ETV4P43268 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ETV4P43268 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ETV4P43268 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ETV4P43268 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ETV4P43268 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms