Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CASP2P42575 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP2P42575 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP2P42575 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP2P42575 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CASP2P42575 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP2P42575 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP2P42575 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP2P42575 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP2P42575 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CASP2P42575 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP2P42575 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP2P42575 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP2P42575 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP2P42575 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP2P42575 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP2P42575 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP2P42575 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CASP2P42575 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP2P42575 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP2P42575 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP2P42575 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP2P42575 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP2P42575 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP2P42575 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP2P42575 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP2P42575 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP2P42575 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP2P42575 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP2P42575 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CASP2P42575 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP2P42575 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP2P42575 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP2P42575 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP2P42575 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP2P42575 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP2P42575 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP2P42575 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CASP2P42575 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP2P42575 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP2P42575 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP2P42575 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP2P42575 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP2P42575 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CASP2P42575 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CASP2P42575 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP2P42575 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP2P42575 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP2P42575 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP2P42575 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP2P42575 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CASP2P42575 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP2P42575 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP2P42575 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP2P42575 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP2P42575 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP2P42575 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASP2P42575 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP2P42575 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP2P42575 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP2P42575 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP2P42575 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP2P42575 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASP2P42575 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP2P42575 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP2P42575 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP2P42575 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP2P42575 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP2P42575 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASP2P42575 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP2P42575 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP2P42575 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP2P42575 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP2P42575 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP2P42575 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP2P42575 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP2P42575 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASP2P42575 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP2P42575 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP2P42575 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP2P42575 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP2P42575 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP2P42575 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP2P42575 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP2P42575 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP2P42575 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASP2P42575 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP2P42575 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASP2P42575 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP2P42575 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASP2P42575 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP2P42575 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP2P42575 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP2P42575 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP2P42575 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP2P42575 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP2P42575 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASP2P42575 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP2P42575 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASP2P42575 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms