Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PIK3CAP42336 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3CAP42336 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PIK3CAP42336 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PIK3CAP42336 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms