Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOBEC1P41238 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOBEC1P41238 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBEC1P41238 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC1P41238 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms