Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
THPOP40225 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
THPOP40225 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
THPOP40225 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
THPOP40225 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
THPOP40225 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
THPOP40225 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
THPOP40225 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
THPOP40225 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
THPOP40225 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
THPOP40225 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
THPOP40225 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
THPOP40225 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
THPOP40225 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
THPOP40225 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
THPOP40225 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THPOP40225 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THPOP40225 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
THPOP40225 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THPOP40225 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
THPOP40225 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
THPOP40225 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THPOP40225 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THPOP40225 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
THPOP40225 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
THPOP40225 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
THPOP40225 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THPOP40225 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
THPOP40225 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
THPOP40225 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THPOP40225 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
THPOP40225 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
THPOP40225 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
THPOP40225 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THPOP40225 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
THPOP40225 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THPOP40225 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THPOP40225 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
THPOP40225 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THPOP40225 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
THPOP40225 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
THPOP40225 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
THPOP40225 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
THPOP40225 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
THPOP40225 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
THPOP40225 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THPOP40225 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THPOP40225 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THPOP40225 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
THPOP40225 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
THPOP40225 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THPOP40225 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THPOP40225 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THPOP40225 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THPOP40225 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
THPOP40225 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
THPOP40225 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THPOP40225 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THPOP40225 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THPOP40225 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THPOP40225 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THPOP40225 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THPOP40225 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THPOP40225 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
THPOP40225 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
THPOP40225 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
THPOP40225 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
THPOP40225 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
THPOP40225 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
THPOP40225 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THPOP40225 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THPOP40225 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THPOP40225 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THPOP40225 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THPOP40225 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THPOP40225 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THPOP40225 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
THPOP40225 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THPOP40225 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
THPOP40225 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THPOP40225 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
THPOP40225 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
THPOP40225 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
THPOP40225 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
THPOP40225 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
THPOP40225 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
THPOP40225 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
THPOP40225 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
THPOP40225 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
THPOP40225 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
THPOP40225 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
THPOP40225 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
THPOP40225 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
THPOP40225 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THPOP40225 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
THPOP40225 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THPOP40225 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THPOP40225 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THPOP40225 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
THPOP40225 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms