Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 NUP53YMR153W 1428 nt6.72□□□□□ -1.33
YAR028WP39548 OPT1YJL212C 2400 nt6.72□□□□□ -1.33
YAR028WP39548 PRP9YDL030W 1593 nt6.72□□□□□ -1.33
YAR028WP39548 HRB1YNL004W 1365 nt6.71□□□□□ -1.33
YAR028WP39548 NUF2YOL069W 1356 nt6.71□□□□□ -1.33
YAR028WP39548 HSP31YDR533C 714 nt6.71□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 BIM1YER016W 1035 nt6.71□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 CTK2YJL006C 972 nt6.71□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 ERG27YLR100W 1044 nt6.71□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 SEC65YML105C 822 nt6.71□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 MCT1YOR221C 1083 nt6.71□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 YPL014WYPL014W 1146 nt6.71□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 YPR127WYPR127W 1038 nt6.71□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt6.71□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 EFM2YBR271W 1260 nt6.71□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 YBR292CYBR292C 372 nt6.71□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 TDP1YBR223C 1635 nt6.71□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 CHS5YLR330W 2016 nt6.71□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 VHS1YDR247W 1386 nt6.7□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 CYB2YML054C 1776 nt6.7□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 CRN1YLR429W 1956 nt6.7□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 RTT103YDR289C 1230 nt6.7□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 PPE1YHR075C 1203 nt6.7□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 YOL035CYOL035C 303 nt6.7□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 RPN8YOR261C 1017 nt6.7□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 SCP1YOR367W 603 nt6.7□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 TIF5YPR041W 1218 nt6.7□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 RPL43AYPR043W 279 nt6.7□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 YOR389WYOR389W 1875 nt6.7□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 ABD1YBR236C 1311 nt6.7□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 GDH1YOR375C 1365 nt6.69□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 RQC1YDR333C 2172 nt6.69□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 AMN1YBR158W 1650 nt6.69□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 YDR124WYDR124W 975 nt6.69□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 TRR1YDR353W 960 nt6.69□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 ARD1YHR013C 717 nt6.69□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 NTG1YAL015C 1200 nt6.69□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 VPS20YMR077C 666 nt6.69□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 YKR015CYKR015C 1707 nt6.69□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 CDC13YDL220C 2775 nt6.69□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 BRL1YHR036W 1416 nt6.68□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 VRP1YLR337C 2454 nt6.68□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 YDL121CYDL121C 450 nt6.68□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 PET117YER058W 324 nt6.68□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 PIL1YGR086C 1020 nt6.68□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt6.68□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 ARG3YJL088W 1017 nt6.68□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 SPO20YMR017W 1194 nt6.68□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 UBA3YPR066W 900 nt6.68□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 SSC1YJR045C 1965 nt6.68□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 BUD26YDR241W 288 nt6.67□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 SKI8YGL213C 1194 nt6.67□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 YSC83YHR017W 1158 nt6.67□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 CTR2YHR175W 570 nt6.67□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 MTR2YKL186C 555 nt6.67□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 YAL064WYAL064W 285 nt6.67□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 MEU1YLR017W 1014 nt6.67□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 YLR118CYLR118C 684 nt6.67□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 IRC5YFR038W 2562 nt6.67□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 TAH11YJR046W 1815 nt6.66□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 HAL5YJL165C 2568 nt6.66□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 YGL218WYGL218W 651 nt6.66□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 THR1YHR025W 1074 nt6.66□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 YMR178WYMR178W 825 nt6.66□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 RRP15YPR143W 753 nt6.66□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 CKS1YBR135W 453 nt6.66□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 SDH8YBR269C 417 nt6.66□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 MSB3YNL293W 1902 nt6.66□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 PTM1YKL039W 1572 nt6.65□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 ERS1YCR075C 783 nt6.65□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 NMA2YGR010W 1188 nt6.65□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 ADE1YAR015W 921 nt6.65□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 URA4YLR420W 1095 nt6.65□□□□□ -1.34
YAR028WP39548 CEM1YER061C 1329 nt6.65□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 MSG5YNL053W 1470 nt6.65□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 CCT3YJL014W 1605 nt6.65□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 DLD1YDL174C 1764 nt6.64□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 GPH1YPR160W 2709 nt6.64□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 GSH1YJL101C 2037 nt6.64□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 RMD1YDL001W 1293 nt6.64□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 DMC1YER179W 1005 nt6.64□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 YML094C-AYML094C-A 402 nt6.64□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 CTA1YDR256C 1548 nt6.63□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 YLR365WYLR365W 333 nt6.63□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 CSM3YMR048W 954 nt6.63□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 KAR5YMR065W 1515 nt6.63□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 ADE17YMR120C 1779 nt6.63□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 CLP1YOR250C 1338 nt6.63□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 ARL3YPL051W 597 nt6.63□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 IFA38YBR159W 1044 nt6.63□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 MSI1YBR195C 1269 nt6.63□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 HBN1YCL026C-B 582 nt6.63□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 RGT2YDL138W 2292 nt6.62□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 CMR1YDL156W 1569 nt6.62□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 YPK3YBR028C 1578 nt6.62□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 HMLALPHA1YCL066W 528 nt6.62□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 MATALPHA1YCR040W 528 nt6.62□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 OCA4YCR095C 1089 nt6.62□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 MRPL28YDR462W 444 nt6.62□□□□□ -1.35
YAR028WP39548 YGL081WYGL081W 963 nt6.62□□□□□ -1.35
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